В 1996 году И. М. Бондаренко сменил место жительства и вернулся в город своего детства. Неуемный характер не позволил писателю «почить на лаврах».
В 1998 году Бондаренко вошел в редакционную коллегию «Энциклопедии Таганрога» и работал над созданием всех трех изданий (1998, 2003 и 2008), причем в последнем издании уже как ответственный редактор.
Игорь Михайлович – один из учредителей краеведческой общественной организации «Таганрогская летопись», созданной 22 февраля 1999 года.
В 2003-2010 гг. И. Бондаренко был председателем правления Таганрогского Чеховского культурного фонда.
В этом же 2003 году получила развитие идея Бондаренко по работе с талантливой таганрогской молодежью. «Издательский дом «Таганiй Рогъ» выпустил первый номер юношеского литературно-художественного журнала «Золотой подсолнух». Идея состояла в том, что все делали дети и подростки до 18 лет. Они были авторами, художниками, редакторами, корректорами, наборщиками. Конечно, им доброжелательно и ненавязчиво помогали взрослые. Проектом руководили И. М. Бондаренко, Г. П. Пономарева и В. И. Чуприна. К сожалению, блестящая идея Игоря Михайловича по развитию творческого потенциала таганрогского юношества как на подводный риф налетела на финансовый вопрос, и на втором номере журнал прекратил свое существование.
Но И. Бондаренко не сдался. Произведения молодых талантливых таганрожцев вошли в его следующий проект – сборник «А. Чехонте…и…», подготовленный писателем к 150-летию со дня рождения А. П. Чехова. Книга вышла в Ростове-на-Дону в 2008 году в прекрасном оформлении, иллюстрирована рисунками Николая Чехова. В сборник включены рассказы молодого Чехова, когда он еще подписывался псевдонимом Антоша Чехонте, и юных таганрожцев Коли Приходько, Лизы Каркищенко, Вики Болестевой.
По заказу Администрации Таганрога к 150-летию со дня рождения А. П. Чехова Игорь Михайлович выступил составителем уникального сборника «Таганрог в литературе», включающего стихи и прозу лучших российских писателей: А. Чехова, А. Пушкина, К. Паустовского, Н. Щербины, В. Парнаха, М. Танича и других. В 2019 году, уже после смерти писателя, было выпущено второе дополненное издание.
В 2007 году за плодотворную трудовую и общественную деятельность и большие заслуги перед городом И. М. Бондаренко присвоено звание «Почетный гражданин города Таганрога».